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核酸質(zhì)譜
核酸質(zhì)譜,是基于MALDI-TOF MS質(zhì)譜發(fā)展起來的一種多重PCR分析檢測系統(tǒng)。核酸質(zhì)譜主要通過多重PCR+高通量芯片+飛行時間質(zhì)譜來實(shí)現(xiàn)核酸檢測,該技術(shù)可實(shí)現(xiàn)單個樣本同時進(jìn)行幾十甚至幾百種靶標(biāo)檢測,每日處理的樣本數(shù)可達(dá)1000例以上。
核酸質(zhì)譜的主要步驟:
1.聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR):根據(jù)待檢測位點(diǎn)設(shè)計(jì)上下游引物各一條,以樣本DNA為模板,進(jìn)行PCR,獲得包含目標(biāo)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物片斷。
2.蝦堿式磷酸酶(SAP)處理:加入SAP(10322ES)對PCR產(chǎn)物進(jìn)行去磷酸化反應(yīng),消除反應(yīng)體系中剩余的dNTP。
3.單堿基延伸反應(yīng):加入一條單堿基延伸引物以及ddNTP,進(jìn)行單堿基延伸反應(yīng)。
4.樹脂純化:加入脫鹽樹脂對延伸產(chǎn)物進(jìn)行脫鹽純化,避免鹽離子峰在質(zhì)譜中對結(jié)果造成干擾。
5.樣品與基質(zhì)結(jié)合:將樣本點(diǎn)到帶有基質(zhì)的芯片上,進(jìn)行質(zhì)譜檢測,不同基因片段最終形成不同的檢測峰圖譜。
近年來核酸質(zhì)譜已成為PCR和NGS之后的又一個分子診斷新平臺。熒光定量PCR檢測速度快,但通量有限,無法方便快捷地滿足對于多基因數(shù)十個至數(shù)百個位點(diǎn)的檢測需求;而高通量測序雖然通量極高,但其檢測成本高、項(xiàng)目檢測周期長、檢測的數(shù)據(jù)也需專業(yè)的分析解讀,技術(shù)門檻較高;而核酸質(zhì)譜穩(wěn)定準(zhǔn)確的檢測結(jié)果和較低的檢測成本滿足了對中等通量位點(diǎn)SNP及基因突變等定性和定量檢測的需求,同時可以進(jìn)行方便快捷的DNA甲基化及拷貝數(shù)變異(CNV)檢測,更凸顯其在基因檢測領(lǐng)域的強(qiáng)大競爭力,從而成為生命科學(xué)特別是臨床診斷領(lǐng)域快速發(fā)展的主力平臺之一。
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